Program Studi Doktor S3 di beberapa Universitas berbentuk sekolah pascasarjana atau bagian dari fakultas tertentu.
Berikut beberapa Program Studi terkait pendidikan Islam yaitu
Pascasarjana
Pascasarjana UIN Bandung Sunan Gunung Djati
Pascasarjana S2-S3 UIN Sunan Gunung Djati Bandung membuka Pendaftaran Mahasiswa Baru Program Magister S2 dan Doktoral S3 dengan program reguler, program khusus
Universitas Ibnu Khaldun atau UIKA Bogor
Universitas Ibnu Khaldun Bogor (UIKA) Bogor merupakan Universitas Islam yang menyelenggarakan berbagai program studi dari 6 Fakultas. Membuka PMB TP 2022-2023 Semester Genjil
Pascasarjana UIN Jakarta
Pascasarjana UIN Jakarta menyelenggarakan dua program yaitu Program Magister Kajian Islam dan Program Doktor Kajiana Islam. Kedua program memiliki 36 kosentrasi.